人民检察院是国家的法律监督机关。1952年5月，成立锦屏县人民检察署，1955年3月，成立县人民检察院，1958年12月，天柱并入锦屏，原两县检察机关合并办公，1961年7月，天柱、锦屏两县恢复原行政县建制，1967年7月，县检察院被撤销,其检察职权被公安机关军事管制小组取代。1978年7月，锦屏县人民检察院恢复重建，1979年12月中旬院内设刑事一科、刑事二科、法纪检察科、监所检察科和院办公室。12月，成立县人民检察院检察委员会，1980年9月，增设经济检察科，将刑事一科、刑事二科合并为刑事检察科。从1980年至今锦屏检察机关历经数次内设机构改革，2002年8月，根据机构改革的精神，县检察院共设8个职能机构，即办公室、政工科（含法警大队）、侦查监督科、公诉科、反贪污贿赂局。2006年1月，渎职侵权检察科更名为反渎职侵权局，2017年反贪污贿赂局、反渎职侵权局职能、人员转隶至县纪监委。2019年6月机构精简成五个部门，分别是政治部、办公室、第一检察部、第二检察部和第三检察部。